东京国立医科大学是日本的国立医科大学之一该大学是东京高等牙医高中学校的前身，该高中学校是1928年在日本建立的第一所牙科教育机构。

　　在1944年4月1日更名为东京医学院并开设了医学系。在1946年8月27日更名为东京医科大学。在1949年6月1日医学院牙科学院附属诊所更名为医院附属医院和牙科附属医院。1951年4月1日最终确定称为东京国立医科大学。建校至今，前后成立多所研究中心和实验室等等。 

　　该大学的使命主要是培养出具有知识和人性的专业医疗人员。在日本该大学与一桥大学、东京工业大学、东京外国语大学这四所大学在2001年3月15日签署“联合国宪章四个大学学报”简称为“四大联盟”并扩大相互教育和研究计划。该大学扮演着学校作为生命科学专业的角色，并讲授基础生理学和基础药理学。该大学在2009年10月21日加入到学术合作网络理事会（medU-net）医疗行业并成为成员之一。

　　截至2018年5月，该理事会的成员机构有242所大学，企业177所，行政管理部27所，其它53所辐射组织研究所。该大学在2010年与御茶水女子大学、学习院大学、北里大学一起成立跨学科生命科学东京财团。该大学在国际活动方面上非常积极与来自美国、厄瓜多尔、智利、中国、英国、丹麦、芬兰、泰国、加纳、哈萨克斯坦、菲律宾、加拿大、马来西亚、缅甸、新加坡等等不同国家的多所医科大学有了亲密的合作关系，特别是牙科系学院。该大学与哈佛大学签订了医学教育联盟协议。该大学与英国伦敦帝国理工学院和澳大利亚国立大学签订了有交换留学生项目。